К 2011 году субъекты Федерации должны перейти на полную компенсацию ОАО „РЖД” выпадающих доходов, возникающих из-за государственного регулирования тарифов на пригородные перевозки.
Сейчас для сохранения сегмента пригородных перевозок компания вынуждена прибегать к перекрестному субсидированию, однако ход структурной реформы железнодорожного транспорта предусматривает отказ от подобной практики после 2010 года.